El Arsenal regresó después de la segunda guerra mundial con el mismo entrenador, George Allison, y algunos jugadores, sin embargo era obvio que la magia de los 30s se había ido.
En la temporada del 46/47 el Arsenal estuvo cerca de descender a segunda luego de quedar 13 en la liga. El entrenador George Alison tras esta mala temporada y teniendo 60 años decidió retirarse del equipo. Su asistente, Tom Whitaker, tomó el mando inmediatamente.
Con un nuevo entrenador, la siguiente temporada fue del Arsenal, sacándole 7 puntos de ventaja al segundo, el Manchester United. Dos años después ganaron la FA cup en un partido contra el Liverpool, con dos goles de Reg lewis.
En el 53 ganaron la liga, sería su único trofeo por 17 años. Los jugadores que en algún momento fueron figuras estaban envejeciendo y el entrenador no podía conseguir gente buena para que juegue. George Allison murió en 1956, el Arsenal trató con un par de ex-jugadores como entrenadores, pero ninguno tuvo éxito, el mejor final de temporada de estos 17 años fue terceros.
El equipo juvenil ganó la FA cup de menores en el 66. El Arsenal terminó sin títulos los 60s, pero el futuro iba a ser mucho mejor.
